1. 咽異物感或癔球感;
2. 聲嘶及發音困難;
3. 慢性咳嗽：多為刺激性乾咳;
還有清嗓、咽痛、呼吸困難、口臭、咽部粘性分泌物增多、咽乾等症狀，其中前三者被認為尤其常見。
直接刺激
反流的酸直接刺激咽喉黏膜引起損傷及不適主訴。正常的喉部上皮中的具有保護作用的物質在喉咽反流病人中缺失，共同減弱了黏膜防禦機制。同時，咽部黏膜缺乏食管的運動廓清能力及唾液中和作用，故較後者明顯對反流刺激更敏感。
迷走反射
反流的物質可以刺激遠端食管，引起迷走反射，引發的慢性咳嗽和清嗓可以對聲帶黏膜造成損傷，同時可以引起上食道括約肌的鬆弛反射，而使反流物進入到咽喉部引起損傷。
和胃食管返流的鑒別：喉咽反流雖然常和胃食管返流並存，但目前仍然傾向於認為喉咽反流和胃食管返流是兩個不同的整體。譬如，喉咽反流常發生於白天，站立或坐位，常以發音困難、聲嘶、清嗓、咽異物感、長期咳嗽、喉部分泌物多、吞嚥不暢感等為主要症狀，纖維喉鏡有相應的杓區及聲帶的特異表現，和上食道括約肌功能不良有關，而胃食管返流常發生於夜間平臥時，以反酸、燒心、胸痛、吞嚥困難等為主要不適，胃鏡可見食管炎、胃食管疝、Barrett食管等相應表現，主要與下食道括約肌功能異常有關。
反流性喉炎西醫治療
抑酸治療聯合生活方式改變
仍然是目前主流的治療方法：後者主要包括避免睡前進食、抬高床頭、減少晚餐攝入、避免過食、戒煙酒濃茶咖啡及高脂類食物、甜食、酸性水果(橘子，楊梅等)、減重等，前二者被認為尤為重要，甚至研究發現單純生活方式改善即可以使咽喉部不適症狀獲得明顯緩解，從而提出把生活方式的改善作為主要治療的觀點。
1.1質子泵抑制劑(PPIs)質子泵驅動細胞內H+與小管內K+交換，質子泵抑制劑阻斷了該交換途徑，較原有的抑制胃酸的藥物組胺受體拮抗劑相比較，作用位點不同，且夜間的抑酸作用好、起效快，抑酸作用強且時間長、服用方便，因此在喉咽反流的抑酸治療中佔據主導地位，治療有效後應逐漸減量。一般應用20-40mg, 每天兩次的治療優於每天一次，長療程可以使症狀改善更加明顯。除此之外，質子泵抑制劑的有效性不僅表現在喉部不適症狀及喉鏡所見表現的改善，其客觀聲學評估參數也隨著治療進程有所改善，可能是因為治療後聲帶腫脹、炎症等情況好轉，毛細血管分佈、粘液量和聲帶黏膜運動的穩定性等局部微觀情況改善。症狀的緩解往往早於喉鏡表現的改善。
長期應用質子泵抑制劑的副作用：抑制鈣的吸收導致骨質疏鬆及骨折(髖部及椎體常見)、艱難梭菌感染引起腹瀉、耐受、停藥後酸分泌反跳性增多、和氯吡格雷合用會增加心血管疾病復發風險、增加胃癌風險(尤其是有Hp感染時)，是否會引起VitB12和鐵的缺乏還有待考證。
1.2. H2-受體阻滯劑：用於拮抗組胺引起的胃酸分泌，主要有西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁等。常在睡前應用。關於其有效性結論不一。可以嘗試對於質子泵抑制劑及生活方式改善治療後仍然無法獲得明顯緩解的病人應用。
復發或療效不佳病例
對PPIs療效不佳的病例，需要考慮是否存在非酸返流、是否是較嚴重的喉咽反流類型及需增加療程劑量的可能性，也應考慮是否診斷有誤，尚存在其他病因，如食管咽返流、過敏、過量煙酒、肺部疾患、鼻竇病變等。可添加組胺受體阻滯劑、促胃動力劑等，並調整生活方式。
食管咽反流
臨床中，經驗性的抑酸治療對相當一部分病人無明顯療效，於是有學者提出食管咽返流(EPR)是可能的原因。其主要和食管的運動不良、括約肌張力下降、容量廓清功能下降有關。常見的症狀有慢性咳嗽、吞嚥困難、發音困難、清嗓、腹脹、打嗝等。可通過伏臥位的食管鋇餐造影見到食管疝、食管失遲緩、口咽的吞嚥活動異常等診斷。
嗓音治療及相關聲學評估
最近的研究發現，對於喉咽反流的病人，加用嗓音治療，可以增強喉咽反流的治療效果，聲嘶、氣短等症狀以及部分嗓音學參數可以獲得令人滿意的改善。嗓音治療是個性化的治療方法;治療的方法的種類會根據病人的情況而改變，也會由於醫生的不同而改變，但是會有相似的效果。
嗓音治療包括間接嗓音治療和直接嗓音治療。其中前者指以嗓音教育為目的，為患者講授正常聲帶解剖和嗓音病理的知識以及嗓音衛生相關知識。直接嗓音治療的目的是提高患者的說話技巧，以達到增加發聲效率和改善嗓音質量的目的。包括嗓音休息(Light and easy talking)、共鳴訓練、腹式呼吸、增加軟起聲、減少硬起聲、氣流訓練、咬音訓練以及局部的喉部按摩(從先前的甲狀軟骨開始，將食指和拇指放置在甲狀軟骨的間隙，並繞圈按摩，從而降低喉位和減少喉上肌肉張力，使用於嗓音功能亢進、聲門功能不足導致的過度肌肉張力)等方法。
外科治療
有症狀的非酸返流(在職業用聲者中常見)、藥物及生活方式聯合療效不佳、返流嚴重、下食道括約肌功能不良、副反應嚴重、年輕病人避免長期用藥或經濟原因等均作為外科治療的適應症。胃底折術是最常見的術式，現在多採用在腹腔鏡下進行操作。將胃底部的黏膜折疊環繞於下端食管，從而加強食管括約肌，來達到控制返流的目的。
新藥
GABAB阻滯劑AZD3355及親代謝性谷氨酸鹽受體5拮抗劑ADX10059可以減少暫時性食管下端括約肌鬆弛，增加其張力，是目前新出現的治療選擇。
反流性喉炎中醫治療
當前疾病暫無相關療法。