透明隔囊腫分為症狀性與非症狀性兩種，前者又稱為擴張性透明隔囊腫，它可造成室間孔的梗阻，產生頭痛、嘔吐、視乳頭水腫及意識障礙等顱壓增高症狀。當透明隔囊腫累及下丘腦-隔三角區或影響腦深部的靜脈回流時，可出現行為、自主神經以及感覺運動功能的異常。一旦發生腦積水，可壓迫視神經通路，引起神經眼科方面的症狀。
先天性透明隔囊腫的病因不明。
要診斷膨脹性透明隔囊腫依據：1、腦室和腦池與該囊腫腔不交通;2、囊腔有分泌液體的能力。
透明隔囊腫西醫治療
1、直接開顱手術：
手術創傷大，基本已經廢棄。
2、囊腫-腹腔分流術：
囊腔置管時盲目穿刺囊腫，可能造成囊腫壁或腦室內靜脈出血。
3、立體定向技術：立體定向可以準確定位，比開顱手術創傷小，在三維重建影影像下，手術術安全的，但是囊腫壁的開口不可能造的很大，本人經驗，最大4mm.
4、微創內鏡開窗技術：創傷小，但是徒手穿刺容易造成偏差。
5、立體定向引導或導航引導下的內鏡手術：結合和立體定向手術定位準確的優點和內鏡可視化的優點，應該說是目前治療透明隔囊腫的最佳方法。
6、服用中藥人參皂甘RH2起到一個預防癌變的作用。
透明隔囊腫中醫治療
當前疾病暫無相關療法。