潛伏期2～3周，起病緩慢，約1/3病例無症狀。以支管-支氣管炎、肺炎、耳鼓膜炎等的形式出現，而以肺炎最重。發病初有乏力、頭痛、咽痛、發冷、發熱、肌肉酸痛、食慾減退、噁心、嘔吐等，頭痛顯著。發熱高低不一，可高達39℃。2～3天後出現明顯的呼吸道症狀，如陣發性刺激性咳嗽，咳少量粘痰或粘液膿性痰，有時痰中帶血。發熱可持續2～3周。熱度恢復正常後尚可遺有咳嗽，伴胸骨下疼痛，但無胸痛。
體檢示輕度鼻塞、流涕，咽中度充血。耳鼓膜常有充血，約15%有鼓膜炎。頸淋巴結可腫大。少數病例有斑丘疹、紅斑或唇皰疹。胸部一般無明顯異常體征，約半數可聞干性或濕性羅音，約10%～15%病例發生少量胸腔積液。
病情一般較輕，有時可重，但很少死亡。發熱3天至2周，咳嗽可延長至6周左右。有10%復發，肺炎見於同一葉或同一葉，少數病人紅細胞冷凝集滴度效價在1︰500以上。/可有相當的血管內溶血，溶血往往見於退熱時，或發生於受涼時。
極少數病例可伴發中樞神經症狀，例如腦膜炎、腦膜腦炎、多發生神經根炎，甚至精神失常等。出血性耳鼓膜炎、胃腸炎、關節炎、血小板減少性紫癜、溶血性貧血、心包炎、心肌炎、肝炎也有發現。
發病原因
支原體穿過宿主呼吸道黏膜表面的黏液纖毛層，黏附於黏膜上皮細胞上，此黏附作用與肺炎支原體表面的P1蛋白的末端結構有關。當此黏附因子附著於呼吸道黏膜上皮細胞時，釋放的有毒代謝產物可導致纖毛運動減弱，細胞損傷。
在我國小兒肺炎四季散發，但多發生在冬季或冬春季節或氣候驟變、感冒多發的季節，南方有時在夏季或夏秋季節也有發病小高峰出現。空氣污染、居室擁擠、屋內通風不良等是小兒肺炎的外環境誘因，而各種呼吸道傳染病、小兒腹瀉、營養不良、貧血、佝僂病等均可以成為小兒肺炎的內在因素，這些患兒一旦發生肺炎，病情往往較重、病程也較長，容易成為遷延。
發病機制
目前認為，其發病機制主要由於支原體穿過宿主呼吸道黏膜表面的黏液纖毛層，黏附於黏膜上皮細胞上，此黏附作用與肺炎支原體表面的P1蛋白的末端結構有關，當此黏附因子附著於呼吸道黏膜上皮細胞時，釋放的有毒代謝產物可導致纖毛運動減弱，細胞損傷。
感染肺炎支原體後，可引起體液免疫和細胞免疫反應，體液免疫應答先出現特異性IgM抗體，然後出現IgG抗體，持續較長時間，鼻咽部局部產生的分泌性IgA抗體，能有效地抑制肺炎支原體與呼吸道上皮結合，呼吸道IgA抗體比血清中抗體對宿主的免疫狀態有更直接關係，在感染防禦上局部抗體甚為重要，局部免疫除IgA外，局部細胞免疫也發揮作用，因為初次感染使幼兒致敏，促使再次感染時發生較重的臨床表現，表明本病與感染肺炎支原體後機體產生超敏反應的關係。
病理改變主要為支氣管炎，毛細支氣管炎及間質性肺炎，管壁水腫，增厚，有浸潤斑，支氣管及細支氣管內有黏液甚至膿性分泌物，鏡下所示為急性細支氣管炎伴有間質性肺炎，肺泡內可見有少量水腫液及巨噬細胞，細支氣管壁有水腫，充血以及單核細胞和淋巴細胞浸潤，腔內可見到中性粒細胞，脫落上皮細胞及細胞殘片，附近的肺泡間隔內有淋巴細胞及單核細胞浸潤，重症可見瀰漫性肺泡壞死和透明膜病變。
診斷
臨床症狀如頭痛、乏力、肌痛、鼻咽部病變、咳嗽、胸痛、膿痰和血痰，肺部X線表現和化驗室檢查如冷凝集試驗等有助診斷。
一、病史、症狀：
起病較緩慢，多數為咽炎、支氣管炎的表現，10%為肺炎。症狀主要有寒戰、發熱、乏力、頭痛、週身不適，刺激性乾咳，伴有粘痰、膿痰，甚至血痰，重者可有氣短，劇咳時有胸痛;也可有噁心、食慾不振，嘔吐，腹瀉及關節痛、心肌炎、心包炎、肝炎、周圍神經炎、腦膜炎、皮膚斑丘疹等肺外表現。
二、體檢發現：
鼻咽部及結膜充血、水腫，可有頸部淋巴結腫大，皮疹;胸部體征多不明顯，肺部聽診可有細濕羅音，偶有胸膜磨擦音及胸水征。
三、輔助檢查：
(一)X線胸片，為肺紋理增多，肺實質可有多形態的浸潤形，以下葉多見，也可，呈斑點狀，斑片狀或均勻模糊陰影。約1/5有少量胸腔積液。
(二)病原學檢查：肺炎支原體的分離，難以廣泛應用，無助於早期診斷。
(三)血清學檢查：血清病原抗體效價>1:32、鏈球菌MG凝集試驗，效價≥1:40為陽性，連續兩次4倍以上增高有診斷價值。血清間接試驗>1:32，間接螢光試驗>1:66，間接免疫螢光抗肺炎支原體IgG>1:16，抗肺炎支原體IgM>1:8，親和素酶聯免疫吸附試驗，可直接檢測肺炎支原體抗原，24小時內可獲結果，均有診斷意義。
鑒別診斷
1.病毒性肺炎：5歲以下小兒多見呼吸道合胞病毒，副流感病毒及腺病毒所致的肺炎，流感病毒性肺炎可見流感患者。
2.細菌性肺炎：肺炎球菌肺炎，起病急驟，常有受寒，淋雨，上呼吸道感染等誘因，有寒戰，高熱，胸痛，鐵銹痰，肺實變體征明顯，血象可見白細胞顯著增高，痰及血中分離病原菌可陽性。
3.鸚鵡熱：有與鳥類(鸚鵡，鴿類)或家禽接觸史，發病急，有發熱，相對緩脈，頭疼，寒戰，確診須賴血清學檢查。
4.立克次體病：主要與Q熱，因Q熱有時以肺炎為主要表現，Q熱患者有與牛，羊，山羊及其乳品的接觸或飲食史，血清補體結合試驗及立克次體凝集試驗可以確診。
5.真菌性感染：念珠菌，隱球菌，毛黴菌，組織胞漿菌，芽生菌等，可取痰，尿作培養與塗片;血清補體結合試驗，瓊脂擴散法等，如檢出陽性結果即可鑒別。
6.肺結核：肺結核起病緩慢，病程較長，痰中可查到結核桿菌。
7.其他：放線菌病，諾卡氏菌病，肺梗死，肺不張，支氣管肺癌，塵肺及與中樞神經系統疾病等也須注意鑒別診斷。
支原體肺炎西醫治療
1、一般治療
呼吸道隔離，休息，供給足量水分及營養。對症治療：忌用水楊酸類藥物以防溶血。一般選用具有緩慢而持久作用的解熱鎮痛藥，如對乙酰基酚、卡巴匹林鈣、賴氨比林、柴胡等，高熱時輔以物理降溫。化痰止咳。清除鼻內分泌物，保持呼吸道通暢。必要時可霧化吸入。
2、抗菌治療
臨床首選紅黴素30～50mg/(kg? d)，分4次口服，成人1.5g/d，分3次口服，療程2～3周。大環內酯類新藥，如羅紅黴素，胃腸副作用少，體液濃度高，細胞穿透力強，半衰期長，用量小，5mg～10mg/(kgd)，分2次口服。新藥阿奇黴素膠囊首劑10mg/(kgd)，以後5mg/(kg?d)，一次口服，5天為一療程。因半衰期長，停藥後藥效尚可持續1周。也有選用諾氟沙星或環丙沙星每次0.4g，2次/d，療程5～7天。
支原體肺炎中醫治療
肺炎屬於溫熱病範疇中的“肺熱喘咳”、“風溫犯肺”等症。常用中藥有：麻黃、杏仁、生石膏、甘草、寒水石、銀花、連翹、蘇子等。發熱有汗可加黃芩，或重用生石膏;發熱無汗時可加鮮蘆根;咳喘多痰加天竺黃、萊菔子等。